Kędziora w wieku 16 lat trafił do Lecha Poznań. Jako zawodnik Kolejorza dwukrotnie wywalczył mistrzostwo i Superpuchar Polski. W 2017 roku przeszedł do Dynama Kijów, z którym zdobył mistrzostwo, dwa Puchary Ukrainy i trzy Superpuchary.
W styczniu 2023 roku obrońca został wypożyczony do PAOK-u, a w 2024 roku podpisał kontrakt z greckim klubem po wykupie za ok. 400 tys. euro. Łącznie rozegrał w nim 141 meczów, w których strzelił cztery gole i zaliczył trzy asysty. Dzięki regularnej grze w Grecji i Europie, jego szacowana rynkowa wartość pozostaje wysoka - to ok. 2 mln euro.
Kędziora wraca do klubu, w którym spędził wiele lat. Jego żoną jest ukraińska modelka Wiktoria Stecyk. Para poznała się w Kijowie, wzięła ślub w 2021 roku.
Dynamo Kijów w zeszłym sezonie zajęło rozczarowujące czwarte miejsce w ukraińskiej ekstraklasie. W lipcu zmierzy się z rumuńską Universitateą Kluż w eliminacjach Ligi Europy.
Ze względu na trwający konflikt zbrojny Ukrainy z Rosją, UEFA nie pozwala na grę ukraińskich klubów na swoim terytorium. Dynamo w sezonie 2026/27 wszystkie mecze w europejskich pucharach w roli gospodarza będzie rozgrywać na Arenie Lublin.
